Già in epoca antica esisteva un orto botanico per la coltivazione e lo studio di erbe medicinali per la preparazione di farmaci per conto dell'ospedale San Matteo. Il giardino si estende per circa tre ettari. All'Orto è annesso l'Istituto di Botanica dell'Università di Pavia.
Nel corso del '700 per studiare particolari innesti vengono creati appositi laboratori di ricerca e costruite le prime serre. In seguito, nei primi del '900, le serre sono state demolite e sostituite dal doppio scalone e dalla fontana tondeggiante, tutt'ora visibili.
Previa prenotazione, oggi è possibile visitare le serre delle piante utilitarie e delle orchidee, nella bella stagione, inoltre, a cura dell'Associazione 'Amici dell'Orto Botanico', è possibile partecipare ad interessanti manifestazioni.
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